Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms