Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRN4Q9NRL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms