Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms