Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms