Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPF2Q9HAU5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms