Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF408Q9H9D4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms