Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOJQ9H4E5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms