Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLIRPQ9GZT3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms