Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PBX4Q9BYU1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX4Q9BYU1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms