Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C9orf16Q9BUW7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms