Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM7Q9BQ49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM7Q9BQ49 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms