Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTAGE1Q96RT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms