Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX22Q96L94 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX22Q96L94 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms