Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM44Q96DX7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms