Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35C1Q96A29 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35C1Q96A29 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms