Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL5Q93034 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL5Q93034 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL5Q93034 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL5Q93034 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL5Q93034 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL5Q93034 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms