Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 32.4
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 530.99■■■□□ 2.556e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.066e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 527.75■■■□□ 2.036e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.966e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.756e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.26e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 514.29□□□□□ -0.126e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-212ENST00000576613 606 ntTSL 310.34□□□□□ -0.756e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 CTDNEP1-202ENST00000570380 506 ntTSL 59.12□□□□□ -0.956e-11■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 FRYL-206ENST00000503339 3482 ntTSL 23.15□□□□□ -1.94e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-207ENST00000546482 1028 ntTSL 27.23□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-209ENST00000549948 934 ntTSL 26.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-210ENST00000551367 513 ntTSL 25.59□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-208ENST00000547657 750 ntTSL 25.43□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-205ENST00000487909 4131 ntTSL 25.42□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-211ENST00000551788 867 ntTSL 25.21□□□□□ -1.584e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MORC3-212ENST00000552581 875 ntTSL 35.14□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 DALRD3-213ENST00000496568 839 ntTSL 222.01■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 DALRD3-212ENST00000492585 561 ntTSL 320.15■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC7.95□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 329.18■■■□□ 2.265e-19■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 327.58■■■□□ 2.015e-19■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ARIH1-209ENST00000567762 319 ntTSL 35.24□□□□□ -1.575e-19■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 COMMD7-204ENST00000610160 1987 ntTSL 221.71■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 TAF13-202ENST00000461096 1076 ntTSL 57.46□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 28.69□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-207ENST00000468892 1360 ntTSL 317.87■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-214ENST00000480562 1182 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-206ENST00000466742 2331 ntTSL 214.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 513.32□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 32.3
PUM2Q8TB72 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 OTUD4-203ENST00000455611 2498 ntTSL 52.1□□□□□ -2.072e-6■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-19■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.95e-19■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 PSPH-210ENST00000437355 1409 ntTSL 513□□□□□ -0.335e-19■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 32.2
PUM2Q8TB72 MFAP3-209ENST00000521527 716 ntTSL 313.57□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 MFAP3-207ENST00000520327 374 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 C4orf46-203ENST00000508836 1103 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.581e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-201ENST00000324987 778 ntTSL 324.89■■□□□ 1.581e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.521e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.191e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.151e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-210ENST00000509933 2241 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-63■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 218.69■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 215.63■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 214.51□□□□□ -0.095e-11■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 DDX47-202ENST00000358007 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.795e-11■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 DDX47-212ENST00000545038 2357 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.25e-11■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.465e-11■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 DDX47-207ENST00000542123 2689 ntTSL 1 (best)3.12□□□□□ -1.915e-11■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.753e-8■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 32.1
PUM2Q8TB72 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.058e-14■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 GNL1-203ENST00000462708 774 ntTSL 27.4□□□□□ -1.228e-14■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 PRPF3-205ENST00000476970 1005 ntTSL 26.45□□□□□ -1.388e-14■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 513.78□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 SCAMP2-207ENST00000566480 2476 ntTSL 511.71□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 32
PUM2Q8TB72 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.226e-10■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 UBAP2-203ENST00000379235 2673 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.78e-10■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.788e-10■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.746e-8■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 TMOD3-207ENST00000560549 1474 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-13■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-13■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 SH3BP1-206ENST00000469947 2612 ntTSL 212.83□□□□□ -0.366e-13■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 211.96□□□□□ -0.496e-13■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-22■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-22■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-22■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 220.11■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 31.9
PUM2Q8TB72 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 516.58■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 31.9
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 153.5 ms