Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTU1Q7Z7A3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTU1Q7Z7A3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms