Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM15Q7Z3B0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms