Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms