Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms