Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDPF1Q6NVV7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDPF1Q6NVV7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms