Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCTP1Q6DN14 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms