Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf135Q5VTT2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms