Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR1Q2NL82 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms