Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA9Q16790 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA9Q16790 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA9Q16790 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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