Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NCOA1Q15788 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
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NCOA1Q15788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NCOA1Q15788 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
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