Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GTF3C1Q12789 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C1Q12789 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C1Q12789 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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