Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD300CQ08708 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms