Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFITM3Q01628 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms