Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3BP58499 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms