Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF3P57682 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF3P57682 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF3P57682 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF3P57682 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF3P57682 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF3P57682 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF3P57682 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF3P57682 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF3P57682 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms