Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2BFSP57053 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms