Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D1P54289 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms