Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-5P52952 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms