Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRE11P49959 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRE11P49959 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRE11P49959 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms