Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms