Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTRLP40313 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTRLP40313 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTRLP40313 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms