Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP6P35125 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP6P35125 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP6P35125 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP6P35125 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP6P35125 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP6P35125 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP6P35125 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP6P35125 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms