Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms