Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPREP23469 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPREP23469 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPREP23469 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms