Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RAP15509 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms