Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms