Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms