Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGA3P0DJD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGA3P0DJD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms