Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC175P0C221 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms