Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGK2P07205 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGK2P07205 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGK2P07205 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGK2P07205 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGK2P07205 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK2P07205 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK2P07205 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK2P07205 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGK2P07205 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGK2P07205 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGK2P07205 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGK2P07205 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms