Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOA1P02647 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOA1P02647 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOA1P02647 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms