Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
I3L3M4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
I3L3M4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
I3L3M4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
I3L3M4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms