Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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